光和七年，黃巾起義爆發(fā)，十分兇猛。他們燒毀官府，殺害吏士，四處劫掠。一個月內(nèi)，全國七州二十八郡都相繼發(fā)生戰(zhàn)事，黃巾軍勢如破竹，州郡失守，吏士逃亡，京都震動。
幽州，涿郡，夏侯惇看著墻上的招募鄉(xiāng)勇的告示，不禁有些惆悵，心想黃巾起義爆發(fā)了，不知道有多少百姓會流離失所，多少將士會丟失性命?！鞍??！辈挥傻靡粐@。突然聽到后面一聲巨響，“大丈夫不為國家出力，何故長嘆?！毕暮類闹幸幌?，目標來了，回身一看，這人身高八尺，豹頭環(huán)眼，燕頜虎須，聲如巨雷，勢如奔馬。這可不就是張飛嘛。“不知壯士是？”該問的還是要問?！拔倚諒埫w字益德，是個屠夫，專好結(jié)交豪杰，剛才看你在這嘆氣，所以問問?！睆堬w說道。“黃巾叛亂，我本想去投我一個當官的堂兄弟，和他一起鎮(zhèn)壓黃巾賊，只可惜沒有猛士愿意同行，所以一嘆?！毕暮類幜艘活D話?！懊褪浚磕憧次胰绾?，我頗有家資，可以招募一些鄉(xiāng)勇一起去投你兄弟，怎樣？”張飛說道?！叭绱耍媸翘昧?。”夏侯惇大喜，沒想到不僅能賺到張飛，還可以拉到一些人馬。
管亥早就被夏侯惇派回去通知曹操準備了。就這樣，在涿郡又待了幾天，夏侯惇和張飛就出發(fā)了，至于張世平和蘇雙，這兩個歷史上資助劉關(guān)張的人，他也不等了，因為他見到了一個人，劉備，夏侯惇感到了不安。于是，他派人給了劉備一些錢，說要訂三百雙草鞋。就這樣，在劉備還在家編草鞋的時候，他就已經(jīng)帶著張飛和三百鄉(xiāng)勇跑了。
一天，隊伍正在行軍，派出去的斥候回來報告，前面幾十里發(fā)現(xiàn)上萬黃巾軍。其實夏侯惇早看見了，但夏侯惇不愿意相信那是一只軍隊，沒有整齊的隊形，不，都沒有隊形，七八十的老叟，抱著孩子的婦人，骨瘦如柴的少年。這那是什么軍隊，這明明就是一大伙流民。
“益德，一會我們盡量招降他們，就不要多殺人了?！毕暮類f道?！盀槭裁?？他們可是黃巾賊啊?！睆堬w感到奇怪。“他們不是什么黃巾賊，只是一伙流民，被黃巾軍裹挾了而已?！毕暮類聹y?！斑@些黃巾賊，真是可恨！”張飛開始大罵?！包S巾軍最開始也是因為吃不上飯了，才造反的，他們又有什么錯。”夏侯惇說道。但是，說什么都沒有用，他們叛亂了，他們就有罪，就是得殺。
兩軍相對，夏侯惇和張飛騎著兩匹馬在最前面。黃巾軍那邊也有幾個人騎著馬在最前面，其中一個人說道：“我乃程遠志，爾等區(qū)區(qū)百人，還不速降！”“叛國逆賊，還不前來送死！”張飛拍馬出戰(zhàn)。黃巾軍那邊也出來一個將領(lǐng)，來戰(zhàn)張飛，剛過來，就被張飛一槍挑了下去，（張飛還沒用上丈八蛇矛）只剩下馬在那走著。“降者不殺！”張飛大喊道。這一嗓子喊出去，真有些黃巾軍沒拿住武器。程遠志一看，這不行啊，于是拍馬向張飛殺去，夏侯惇挺槍直出，直接刺中程遠志心窩，落馬。夏侯惇見黃巾軍好像要跑，連忙揮軍追趕，一邊追一邊高喊“降者不殺！”投降者不計其數(shù)，夏侯惇從黃巾俘虜中調(diào)出身體健壯的，編入隊伍，其余的，交給周邊官府，然后又上路了，現(xiàn)在越快越好，曹操還等著他們回去呢。
夏侯惇與曹操終于會合了，最有意思的是，馮賢改名了，馮賢在過潼關(guān)的時候，發(fā)現(xiàn)過潼關(guān)需要登記姓名，馮賢不知道該怎么辦了，他看見天上飛過一只羽毛很漂亮的鳥，又看了看前面的關(guān)卡，有主意了“在下關(guān)羽。”曹操還出錢給張飛打造了一把丈八蛇矛，至于關(guān)羽的青龍偃月刀曹操早就給他造好了。
還沒來得及好好歇歇，命令就來了。漢軍將領(lǐng)朱儁、皇甫嵩首戰(zhàn)不利，進駐長社防守，結(jié)果被黃巾波才率大軍圍城，漢軍人少，士氣低落。讓曹操率軍救援。曹操也不含糊，帶著五千人馬連夜出發(fā)，花了好幾天，終于到達長社附近，找了個地方安營扎寨，幾十里外就是黃巾軍。
夏侯惇和曹操還有關(guān)羽張飛、管亥來到一個小山坡上，小心翼翼地觀察著黃巾軍的營寨。夏侯惇清清楚楚的看到黃巾軍的營寨周圍有很多的雜草，于是，回營后，夏侯惇說了自己的想法?！拔铱匆姅耻姞I寨周圍有很雜草，我們可以用火攻破敵，黃巾軍必敗?！睔v史上也是這樣的，不過是皇甫嵩用的火攻，曹操等人配合，這回反過來了。
傍晚時分，黃巾軍正在造飯。他們并沒有注意到附近有一些士兵拿著火把點燃了地上的雜草。黃巾軍的首領(lǐng)波才也多次提醒軍士和隨行的民眾，把營地內(nèi)部和周圍的荒草都鏟干凈，可是對于他們來說，枯黃后的野草正是墊著睡覺的好材料，所以黃巾軍營寨里的荒草非但沒有減少，反而越來越多。
“失火啦，失火啦！”黃巾軍營寨內(nèi)外各處都開始出現(xiàn)大火，無數(shù)黃巾軍在亂竄和高喊，想躲避大火，軍營中亂成了一團。波才從睡夢中驚醒，他沖出帳篷，看著眼前的景象，心中大驚。突然，營寨外鼓聲大作，曹操軍殺了進來，夏侯惇一馬當先，看見了前面的波才，直接沖了過去，二話不說，一槍將其刺死。城中的朱儁、皇甫嵩也殺了出來，與曹操夾擊黃巾軍，黃巾軍大敗，被斬殺過萬人，要不是夏侯惇讓軍士們高喊降者不殺，死的人更多。
戰(zhàn)后，曹操因功被封為濟南相，上任去了。而夏侯惇帶著關(guān)羽張飛和管亥隨皇甫嵩、朱儁追擊汝南、陳國的黃巾，波才死后，黃巾軍推舉彭脫為帥，被朱儁和皇甫嵩大敗，彭脫被夏侯惇一槍挑死。剩余的黃巾軍想要逃去宛城，但是被孫堅大敗，豫州的黃巾軍被成功平定。之后，夏侯惇等人隨皇甫嵩北上。
在東郡的蒼亭碰上了一伙黃巾，七八千人，領(lǐng)頭的叫卜己。兩軍殺到一起，夏侯惇和管亥帶兵從西邊沖入敵陣，關(guān)羽張飛帶兵從東邊殺入敵陣，這是以前就商量好的。管亥沖到卜己面前，二人戰(zhàn)了起來，打了半天，卜己轉(zhuǎn)身便走，正好碰到關(guān)羽，被一刀斬殺，黃巾軍開始潰敗。
之后，夏侯惇等人與皇甫嵩繼續(xù)北上，到達廣宗。這時，張角已經(jīng)病死?；矢︶攒娕c張梁軍對峙?！艾F(xiàn)在我軍與黃巾賊首之一張梁兩軍對峙，諸位有何良策？”皇甫嵩在大營中說道?！皩④?，我們可以閉營讓士兵休息，同時派人觀察敵軍動向，等敵軍松懈的時候，再出擊?！毕暮類f道?；矢︶酝饬讼暮類南敕?，因為他其實也有這個想法，歷史上他就是這么大敗張梁的。
一天接近黎明的時候，皇甫嵩覺得差不多了，就下令出兵，夏侯惇仍然和平常一樣，一馬當先，關(guān)羽張飛還有管亥也緊隨其后，皇甫嵩負責(zé)指揮他們。黃巾軍大亂，張梁見勢不好，晃動著手中的長槍，口中念起咒語，開始施展妖法。霎那間，周圍變得黑霧繚繞，根本看不清東西，大家都不知道怎么辦。除了夏侯惇，他的右眼即使在這種情況，也可以看的清清楚楚，夏侯惇向張梁殺去，張梁揮起長槍，只一下，夏侯惇手中的長槍便被張梁的長槍打斷，這長槍是個什么寶貝，夏侯惇立刻對張梁使用了催眠，“亂臣賊子，你有何面目活在世上，還不自裁！”張梁聽到這話，當即自殺，黑霧也隨之散去。夏侯惇拿起張梁的長槍，這確實是個好寶貝呀。關(guān)羽張飛還有管亥接著追殺黃巾軍，斬殺三萬多人，黃巾軍在逃跑到河堤時還溺死了五萬多人，俘獲人數(shù)不計其數(shù)。張角、張梁的尸體被砍下首級，運往了京城。之后，夏侯惇等人隨皇甫嵩轉(zhuǎn)戰(zhàn)曲陽，張寶被夏侯惇所殺，黃巾起義平息了下去。
夏侯惇被封為魏郡太守，多少因為曹家和夏侯家的關(guān)系。關(guān)羽張飛去幫曹操了。管亥，被夏侯惇留在了身邊。