在大換裝的基礎(chǔ)上，陳憲對軍隊的組成方式進行了大幅度的改革。
首先，他將步兵方陣中火槍兵的人數(shù)大幅度提升，達到和長槍兵一比一的比例。
一個步兵營的人數(shù)由原本的六百多人提高到了九百多人，其中四百長槍兵，四百火槍兵，他取消了步兵方陣中斧槍兵和劍盾兵。
在歷次的戰(zhàn)斗中，陳憲發(fā)現(xiàn)，這兩種兵種的使用頻率相對比較低，而且難以訓練。
火槍兵人數(shù)提高之后，就不能在布置在長槍方陣四角了，而是放在了長槍兵方陣的兩側(cè)，組成兩個和長槍方陣一樣，十排縱深的方陣，這樣的縱深，哪怕是用火繩槍，也能打出持續(xù)性的火力攻擊。
為了在受到騎兵沖擊時，更好的保護火槍兵，陳憲在火槍兵方陣的最外圍防止了一圈長槍兵，當作戰(zhàn)時，這些長槍兵將會蹲下來形成拒馬，火槍則在他們的保護下向外開槍。
陳憲還給每個步兵營配備了大約一百人的擲彈兵，這些士兵體格強壯，能夠?qū)⒂描T鐵制作的沉重手雷扔出去很遠。
這些擲彈兵除了配備沉重的手雷，還配備著精度較高的轉(zhuǎn)輪火槍以及刺刀，陳憲還對這些士兵進行了嚴格的射擊訓練和肉搏訓練，讓他們可以發(fā)揮更多的作用。
在陳憲的設計中，擲彈兵是方陣中的自由人，他們也是方陣的偵察兵和警衛(wèi)哨兵。
陳憲考慮再三后，在馬步兵中也編制了一些長槍手，用來在作戰(zhàn)中保護火槍手，不過這種長槍手人數(shù)比例比較低，只能在火槍手外圍形成一圈的拒馬。
為了增強輕騎兵的作戰(zhàn)能力，陳憲別出心裁的制造出了轉(zhuǎn)輪打火的火槍。
轉(zhuǎn)輪打火，解決了火繩槍在馬背上使用的不便，讓輕騎兵能在馬背上也能方便射擊。
陳憲之所以要開發(fā)復雜又不可靠的轉(zhuǎn)輪打火裝置，一是為了推遲燧發(fā)槍暴露的時間，二也是為了積累一些技術(shù)，為將來發(fā)展鐘表制造業(yè)打下一些基礎(chǔ)。
之所以要發(fā)展鐘表業(yè)，一方面精確的計時和守時的觀念，對于工業(yè)社會來說，十分重要，另外，鐘表在航海上也非常重要，雖然不知道在自己的有生之年能不能發(fā)展處航海鐘這種航海里程碑式的東西，但至少也得朝這方面去努力。
轉(zhuǎn)輪打火設備并不復雜，和老式的打火機很像，一個表面有著類似老式硬幣外援齒痕的轉(zhuǎn)輪，轉(zhuǎn)輪下面安裝一個燧石，燧石下面有一個彈簧將燧石推著抵住轉(zhuǎn)輪，撥動轉(zhuǎn)輪，就能摩擦出火花，進而點燃火藥。
火槍的轉(zhuǎn)輪打火裝置中，轉(zhuǎn)輪的轉(zhuǎn)動力量由發(fā)條提供，士兵先上緊發(fā)條，然后扣動扳機，松開發(fā)條的鎖緊裝置，發(fā)條的勢能釋放，推動轉(zhuǎn)輪轉(zhuǎn)動，摩擦燧石，擦出火花……
發(fā)條的制造，陳憲采取了先用精煉的鐵片卷成型，在將鐵卷進行滲碳淬火……
推動燧石的彈簧用簧片代替，燧石打磨成柱狀，安裝在燧石桶里，依靠簧片和頂桿施加壓力，抵住轉(zhuǎn)輪。
這樣的裝置，對于陳憲目前的手工作坊來說，并不困難。
不過因為產(chǎn)量問題，這種轉(zhuǎn)輪火槍只供給輕騎兵和擲彈兵。
有了這種火槍，輕騎兵就能在馬上開槍和裝彈。
有了能在馬上使用的火槍，陳憲嘗試著讓輕騎兵訓練組成橫排，沖到火槍射程內(nèi)，對著敵鎮(zhèn)打出一個排槍，然后調(diào)轉(zhuǎn)馬頭離開，重新裝彈，這種戰(zhàn)術(shù)已經(jīng)接近后世十八世紀的獵騎兵了。
為了增加輕騎兵在追擊時的持續(xù)作戰(zhàn)能力，陳憲還給每個輕騎兵裝備了兩把短火槍，作為備用槍械，以及一把輕便的馬刀作為最后的武器。
這樣的輕騎兵有著訓練比較簡單，對戰(zhàn)馬要求不高，火力兇猛，行動迅速，機動性高，用途多樣的有點，補充起來也比較容易，不像弓騎兵，要花費大力氣才能訓練出來，還肯定不是蒙古騎兵的對手。
陳憲花費了半年時間才完成了這次軍事改革。
他一邊對軍隊進行改革，一邊招募新兵補充進增員后的軍隊，一邊擴大軍隊的規(guī)模。
在完全掌控了萊蕪縣的八萬多人口之后，陳憲自然就有了大規(guī)模擴軍的資本。
經(jīng)過半年時間的招募和訓練，陳憲將軍隊擴大到了八個步兵營，七千多人，騎兵擴大到了兩千四百人。
陳憲對騎兵的編制是一百人一個連，四個連一個營。
這次他將每個騎兵兵種都擴編到了兩個營。
這樣一來，陳憲手下就有了八個步兵營，六個騎兵營，總兵力接近一萬人！
陳憲又將八個步兵營分別組成了兩個步兵團，一團團長由李石擔任，二團團長由張柏擔任。
除了軍隊的擴張和改進，在政府方面，陳憲也進行了調(diào)整，他將手中的地盤分為萊蕪和沂源兩個縣。
萊蕪縣令由陳憲自己兼任，他在萊蕪縣也成立了一套和沂源縣一樣的縣級政府機構(gòu)。
在縣級政府機構(gòu)之上，陳憲自封為魯山侯，組建侯國政府，在這一級政府，陳憲沒有成立督政院，而是由侯爵，也就是自己獨裁，侯國法院，侯國檢察院，都是侯府的下屬機構(gòu)，審計院也由督政院的下屬機構(gòu)變成了侯府的下屬機構(gòu)。
之所以采取這種地方選舉自治，中央獨裁的的行政模式，是因為陳憲覺得，如果他太早的在上層實現(xiàn)選舉制度，會讓他建立的這個勢力會失去控制，而沒有陳憲親自把控方向，那誰也不知道這個勢力最終會發(fā)展成什么樣子。
陳憲還在侯府下面成立了將軍府，也由自己擔任將軍府將軍。
在將軍府下面，他成立了負責制定作戰(zhàn)計劃的參謀部，負責后勤補給的后勤部，負責武器裝備研發(fā)采購的裝備部，負責軍紀軍法的憲兵部，負責訓練的武訓司，負責軍官的考察，評定，升遷，調(diào)職的武選司，負責軍事情報的情報司……
當然，這些機構(gòu)雖然建立起來了，但大多還是個空架子，還需要時間去明晰各個機構(gòu)的職權(quán)范圍，逐漸豐滿工作流程，這些東西，陳憲不可能都去親力親為，他沒有那個精力和能力。