在《大唐雙龍傳》中有所謂佛與魔的千年?duì)幎?，這不只是正邪之分，也是思想與智慧的道統(tǒng)之爭(zhēng)。魔門本來(lái)叫圣門，西漢的董仲舒罷黜百家獨(dú)尊儒術(shù)之后，正統(tǒng)的教派都對(duì)他們展開(kāi)了打壓與剿滅，但是他們依然生存了下來(lái)，所以成為世人眼中的魔，也被稱為魔門。因?yàn)槟чT不講仁義道德，一切都以利益為先，所以魔門中人常常為達(dá)目的不擇手段，這不是一般人能夠接受的，所以也就與佛道兩門展開(kāi)了上千年的斗爭(zhēng)，這些爭(zhēng)斗皆在暗中進(jìn)行甚少有人知道。
正道雖打壓魔門多年，卻依然拿對(duì)方?jīng)]有辦法，雙方也產(chǎn)生了一些斗爭(zhēng)的默契。但這種默契卻在一個(gè)人的手中結(jié)束了——他叫石之軒人稱邪王，他是魔門百年不出的奇才，他身兼魔門“花間派”和“補(bǔ)天道”的掌門，他化名裴矩出仕為官，他讓好大喜功的楊廣不斷出兵，導(dǎo)致統(tǒng)一數(shù)十年的中國(guó)又要重歸亂世。
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魔門的人也趁機(jī)擴(kuò)張勢(shì)力，因?yàn)樗麄兪芊鸬来驂阂丫?，這時(shí)好不容易占了上風(fēng)，所以不斷派出門人支持門閥中人，或是占據(jù)城池割據(jù)，而佛道中人一向習(xí)慣把守自身不擾世事，所以不太方便出山來(lái)管塵世間的亂世。但是他們沒(méi)有想到，意外修煉成“長(zhǎng)生訣”的寇仲與徐子陵，總是亂拳打死老師傅，他們每每在意外之中破壞了魔門的好事，這兩個(gè)看似不起眼的小子更是逐漸成長(zhǎng)成一方高手，成為破壞與亂源的集合體。
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佛門以慈航靜齋為首，里面都是女尼，修煉的“慈航劍典”與“長(zhǎng)生訣”同為武林四大奇書(shū)，剩下的兩大奇書(shū)則是魔門陰癸派的絕學(xué)“天魔策”和最神秘莫測(cè)的“戰(zhàn)神圖錄”。佛門最強(qiáng)四人被稱為四大圣僧，他們的修為已達(dá)出神入化之境，與道門的中土第一高手散人寧道奇，共同為中原武林的泰斗，但他們終究都是修行中人，不太愿意干擾世事太多，于是支持李唐政權(quán)的李世民。
佛道兩門打算來(lái)讓李唐來(lái)統(tǒng)一天下，可是以陰癸派為首的魔門中人可不想束手就擒，他們混入李唐政權(quán)，成為李閥之主的李淵的心腹，他們打算顛覆李唐政權(quán)，并且想要將正道支持的李世民殺掉。
因?yàn)槔铋y的正式繼承人是太子李建成，而李閥之主李淵則長(zhǎng)期在皇宮里受到妃嬪與李建成等皇族的耳語(yǔ)，李淵也認(rèn)為李世民有一天可能會(huì)擁兵自立，所以有想要將李世民軍權(quán)收回，甚至有置于死地的想法，至于齊王李元吉?jiǎng)t想制造混亂來(lái)讓李建成、李世民都死了，他成為唐主。在這樣的情況下，如果唐室有外敵的一天，李世民便不會(huì)被召回殺害，所以寇仲與徐子陵加入了王世充的一方。