序-2-初戰(zhàn)
開(kāi)篇小劇場(chǎng)（之后的每一集都會(huì)有，用于補(bǔ)完新世界的設(shè)定和搞笑日常）
巧和藍(lán)格雷搬到了新家，房子很不錯(cuò)，真嗣他們?nèi)サ搅饲傻男录议_(kāi)一個(gè)搬家party。當(dāng)玩的盡興時(shí)，真嗣問(wèn)巧。
真嗣：你把我們的事寫(xiě)成了小說(shuō)，但我怎么感覺(jué)我在小說(shuō)里行為很迷惑啊，什么是真正的自己??？
巧：這個(gè)我也不大清楚，因?yàn)槟阄沂峭粋€(gè)人嘛，不是有句話嗎“這世上沒(méi)有兩片相同的葉子”。我是舊世界的碇真嗣，你是新世界的碇真嗣，一個(gè)世界同時(shí)存在兩個(gè)一樣的人，難免會(huì)產(chǎn)生些沖突。順便告訴你，其實(shí)初號(hào)機(jī)的第一次暴走不是因?yàn)槟悖俏以诓倏v初號(hào)機(jī)。
真嗣：好哇你，合著那次暴走我操作了個(gè)寂寞。
眾人歡笑一片。
正篇開(kāi)始
空無(wú)一人的街道，初號(hào)機(jī)躺在一旁的大廈旁，當(dāng)眾人以為沒(méi)有希望能夠戰(zhàn)勝使徒是，初號(hào)機(jī)的左眼亮起，初號(hào)機(jī)再次啟動(dòng)。這時(shí)的初號(hào)機(jī)本應(yīng)是靜止?fàn)顟B(tài)，但是突然自己?jiǎn)?dòng)，各種信號(hào)全都不接收，所有將此情況定為“暴走”
再次啟動(dòng)的初號(hào)機(jī)張開(kāi)了血紅的嘴，哈了一口氣，向著天空發(fā)出了一陣咆哮。初號(hào)機(jī)一個(gè)彈射起步跳到了使徒身上與使徒糾纏了一會(huì)，隨后踹開(kāi)使徒落到地上，一個(gè)轉(zhuǎn)身便奔向使徒。從這一刻開(kāi)始，戰(zhàn)斗的勝負(fù)已是板上釘釘?shù)氖铝?。初?hào)機(jī)攻向使徒，但是被at立場(chǎng)擋住，當(dāng)眾人以為無(wú)法打破at立場(chǎng)時(shí)，初號(hào)機(jī)也開(kāi)啟了立場(chǎng)，并且在侵蝕這對(duì)方的立場(chǎng)。初號(hào)機(jī)想要掰開(kāi)使徒是立場(chǎng)，但一只手的力掰不開(kāi)，初號(hào)機(jī)立刻復(fù)原了剛剛被掰斷的手，兩只手一起撕扯著立場(chǎng)，立場(chǎng)也很快被撕開(kāi)了。使徒發(fā)射死光，即使被擊中，初號(hào)機(jī)也毫發(fā)無(wú)損，初號(hào)機(jī)抓住了使徒的兩只手狠狠的將手掰斷，還把使徒踢飛
使徒還沒(méi)反應(yīng)過(guò)來(lái)時(shí)，初號(hào)機(jī)又將使徒撲倒，用拳頭錘向使徒和核心，然后掰斷了核心兩邊的次，用刺狠狠的敲擊使徒核心，沒(méi)幾下核心就被敲出了許多且巨大的裂痕。見(jiàn)狀不妙，使徒利用自己的身體包住初號(hào)機(jī)并將自己自爆，企圖極限一換一，但是沒(méi)用。一道巨大的十字架閃爍著，直插云霄，天空中還有一道彩虹亮著。使徒將自己自爆，化成血雨，朦朧血雨中，初號(hào)機(jī)的身影矗立在這血雨之下，呈現(xiàn)出一種恐怖。
赤木：你就是EVA的...
美里：真正的樣子嗎。
戰(zhàn)斗結(jié)束，真嗣昏迷了，救出真嗣后就送到了醫(yī)院，在醫(yī)院里，真嗣做了一個(gè)奇怪的夢(mèng)。夢(mèng)見(jiàn)一對(duì)看不清臉的夫婦談?wù)撝鴮?lái)孩子的名字。父親說(shuō)“如果是男孩就叫真嗣，如果是女孩就叫麗”母親聽(tīng)后不斷重復(fù)著“真嗣”和“麗”，然后說(shuō)了一句“是綾波麗”。真嗣驚醒，冒著冷汗的真嗣坐起，看了看周?chē)l(fā)現(xiàn)是醫(yī)院后躺又了回去，說(shuō)道“陌生的天花板”
此時(shí)的碇源堂與seele的成員討論著這次初號(hào)機(jī)與第四使徒的戰(zhàn)斗，說(shuō)這些都跟計(jì)劃的一樣，但初號(hào)機(jī)龐大的修理費(fèi)卻在意料之外，但與凍結(jié)著的零號(hào)機(jī)相比并不是什么問(wèn)題。這時(shí)美里那邊已經(jīng)完成了回收初號(hào)機(jī)的任務(wù)，而初號(hào)機(jī)爆走的數(shù)據(jù)卻消失了，容量為0，沒(méi)有任何數(shù)據(jù)。
美里：結(jié)果原因不明啊，但做為武器可靠性還是太苛刻了吧。
雖然初號(hào)機(jī)的修理費(fèi)用巨大，但是可以確保在第五使徒來(lái)襲時(shí)初號(hào)機(jī)能夠使用?，F(xiàn)在初號(hào)機(jī)已經(jīng)投入實(shí)戰(zhàn)，二號(hào)機(jī)及其駕駛員都在德國(guó)接受訓(xùn)練，三號(hào)機(jī)也在按照計(jì)劃建造著。seele將統(tǒng)率NERV和EVA的責(zé)任交給了碇源堂，seele不想讓碇源堂給他們帶來(lái)失望。而殲滅使徒也只不過(guò)是與莉莉絲的契約中的一小部分?！度祟?lèi)補(bǔ)完計(jì)劃》才是seele的真正目的，為了能夠造福人類(lèi)，所有的一切都要按照seele的劇本進(jìn)行。
此時(shí)的碇真嗣站在醫(yī)院的走廊邊，他靠著窗戶看著外面的風(fēng)景。遠(yuǎn)處兩個(gè)醫(yī)生推著擔(dān)架走來(lái)，而擔(dān)架上的人正是綾波麗，與真嗣擦肩而過(guò)的那個(gè)瞬間跟真嗣對(duì)視了一下，隨后就被帶走了。
美里幾人再次來(lái)到昨晚的事發(fā)地點(diǎn)，此時(shí)的這里早已變成如同地獄般的血海。赤木研究過(guò)后，發(fā)現(xiàn)使徒失去了at立場(chǎng)時(shí)使徒就會(huì)崩解。伊吹看著這一片血海，感覺(jué)像是第二次沖擊，給人一種不安的感覺(jué)。EVA能夠戰(zhàn)勝使徒，這意味著人類(lèi)還有一絲希望，而這一絲希望交給了EVA的駕駛員。此時(shí)美里收到消息，醫(yī)院那邊說(shuō)真嗣他已經(jīng)清醒了，美里也沒(méi)有怠慢，立刻起身前往真嗣所在的醫(yī)院。
真嗣坐在某一層的大廳，看著昨晚駕駛EVA時(shí)本應(yīng)被扭斷的左手，美里從遠(yuǎn)處走來(lái)，然后帶走了真嗣。當(dāng)電梯來(lái)的時(shí)候，里面的人卻是自己最恨的父親，父子兩人四目相對(duì)，誰(shuí)也不讓誰(shuí)的表情。等了一會(huì)電梯走了。
美里帶著真嗣回到了NERV，碇真嗣被安排在基地上方附近的單人公寓里面，但是美里擔(dān)心起真嗣，擔(dān)心真嗣一個(gè)人住不方便。
真嗣：沒(méi)關(guān)系，反正我到那都一樣。
美里不想讓真嗣一個(gè)人住，所有她掙得上頭同意，把真嗣帶回自己家里住。然后打電話向好友赤木報(bào)告。
赤木：你說(shuō)什么？
美里：我是說(shuō)，讓真嗣到我那里住，上面也同意了。別擔(dān)心，我不是正太控，對(duì)小男生沒(méi)有興趣。
赤木：那也不行，真是的，你總是這樣......
美里一邊說(shuō)赤木像以前一樣沒(méi)有幽默感又一遍把電話掛了。黃昏之時(shí)，美里帶著真嗣回家，準(zhǔn)備開(kāi)一個(gè)歡迎新室友的party，到了便利店，在結(jié)賬時(shí)美里聽(tīng)見(jiàn)有人談?wù)撨@昨晚的事件，但并沒(méi)有在意。公路上，美里告訴真嗣她要繞個(gè)遠(yuǎn)道，想給真嗣看樣?xùn)|西，到達(dá)了地點(diǎn)后美里把車(chē)停在一邊，讓真嗣下了車(chē)，走到了路邊柵欄旁，俯視這一座城市。
真嗣：總感覺(jué)這座城市很蕭條呢。
美里看著手表。
美里：時(shí)間到了。
城市里響出警報(bào)，地上的巨大蓋板打開(kāi)了，里面冒出許許多多的高樓大廈，原本的空曠城市瞬間成為了迎接使徒的要塞都市-第三新東京市。真嗣看著這一景象，萬(wàn)丈高樓平地起，不經(jīng)讓人感嘆。
美里：這不僅是我們生活的城市，也是真嗣你所要保護(hù)的城市。
夜晚，美里和真嗣回到了家，在跟美里的談話中，美里說(shuō)自己也剛搬來(lái)這里幾天，美里站在里面邀請(qǐng)真嗣進(jìn)來(lái)。
真嗣：打擾了。
美里：真嗣，這里以后可是你的家了，進(jìn)來(lái)吧，說(shuō)一句“我回來(lái)了”
真嗣走進(jìn)去了，遲緩，說(shuō)道“我，我回來(lái)了”
美里：歡迎回來(lái)。
進(jìn)門(mén)后，美里告訴真嗣房間有點(diǎn)亂，可一打開(kāi)燈瞬間讓真嗣感到驚訝，滿屋子都是垃圾，什么吃完了的方便面桶，吃完了的快餐盒，一堆散落在地面的快遞盒，以及喝完了的啤酒管。真嗣找到了冰箱，準(zhǔn)備把剛買(mǎi)好點(diǎn)東西冷藏起來(lái)，但不看不知道，一看嚇一跳，冰箱里滿是零食啤酒，這不由的讓真嗣幻想美里每天過(guò)著什么生活。
美里把買(mǎi)好的快餐加熱了一下端了出來(lái)，這就是真嗣今天的晚餐。美里開(kāi)了一罐啤酒，豪邁的喝了下去，發(fā)出了奇怪的叫聲。
真嗣：您是毛利小母狼吧。
美里：說(shuō)了多少遍了，諧音梗要扣錢(qián)的，而且你怎么不吃啊？
真嗣：我不太喜歡吃速食品。雖然它方便快捷味道正常。但我吃不慣。
美里：這樣啊，但是還是得吃點(diǎn)，今天回來(lái)晚了，外面的店都打烊了，沒(méi)辦法。而且今天開(kāi)始這里就是你的家了，不要拘束。
真嗣：那我以后就不客氣了。
美里：好了，趕緊吃吧，然后洗個(gè)澡把所有不愉快的事通通洗掉。
晚飯過(guò)后，真嗣脫下了衣服準(zhǔn)備洗澡，他抬頭一看，上面的衣架掛著的全是女性的內(nèi)衣褲，但真嗣完全不為所動(dòng)，仿佛是見(jiàn)慣了一樣。
真嗣：女性內(nèi)衣褲而已，又不是啥私服，有啥大驚小怪的。
當(dāng)真嗣打開(kāi)浴室門(mén)的瞬間，被一個(gè)不明生物嚇到了，當(dāng)真嗣問(wèn)美里那個(gè)生物是什么時(shí)，美里告訴他這個(gè)生物是一種高智商的新品種，溫泉企鵝，屬于鳥(niǎo)類(lèi)，名叫片片，是同房的室友。美里拿起一旁的啤酒說(shuō)“你不遮一下嗎？”回過(guò)神來(lái)的真嗣遮著下體快速的跑到浴室里。
美里：嗯....他是在試探我嗎？
真嗣在浴室里泡著澡，回想起曾經(jīng)不愉快的事情，他一頭扎進(jìn)水里，過(guò)了一會(huì)出來(lái)，他拿起毛巾擦拭著臉，說(shuō)“舒服多了”
此時(shí)，赤木與碇源堂在破了的實(shí)驗(yàn)室里，赤木向碇源堂尋問(wèn)麗的狀況，因?yàn)槌嗄局理衷刺媒裉烊チ酸t(yī)院。
碇源堂：她沒(méi)問(wèn)題，現(xiàn)在優(yōu)先要做到就算重啟被凍結(jié)的零號(hào)機(jī)。
赤木：您兒子還好嗎，聽(tīng)說(shuō)他精神狀態(tài)不太穩(wěn)定。
碇源堂：沒(méi)事，你別看他還小，他不論過(guò)去，現(xiàn)在還是未來(lái)，經(jīng)歷的可不比我們現(xiàn)在的要少。
美里家中，真嗣聽(tīng)著隨身聽(tīng)里的歌曲緩緩入睡。還在洗澡的美里想起最近發(fā)生的一切。沒(méi)有任何預(yù)兆突然選出第三位適格者，使徒也正好在這個(gè)時(shí)候來(lái)襲，真嗣被強(qiáng)行加入NERV，這一切如同被計(jì)劃好的一般同時(shí)來(lái)到。
不久后，真嗣來(lái)到了新學(xué)校-新東京市第一中學(xué)，應(yīng)為一些原因真嗣是駕駛員的身份暴露了，他被一位叫鈴原東治的同班同學(xué)打了，因?yàn)橹澳谴螒?zhàn)斗讓他的妹妹受傷了。
真嗣：這我有什么辦法，有人平安就意味著有人受傷，戰(zhàn)爭(zhēng)就是這樣，就連硝煙都比人類(lèi)有色彩。
真嗣拍了拍身上的塵土，隨后轉(zhuǎn)身離去。有過(guò)了幾天，真嗣一如既往的接受這訓(xùn)練，這讓真嗣感到非?？菰锴曳ξ?。美里跟赤木在聊天，她們坐在運(yùn)輸機(jī)談?wù)撨@真嗣這幾天在學(xué)校的表現(xiàn)。赤木聽(tīng)說(shuō)真嗣轉(zhuǎn)學(xué)第一天就被打了，美里說(shuō)不要太多干涉他的私生活，赤木又說(shuō)美里跟真嗣不是住一起嗎？但最近這幾天相處下來(lái)美里發(fā)現(xiàn)真嗣他非常復(fù)雜，難以捉摸。時(shí)而外向時(shí)而內(nèi)向，時(shí)而敞開(kāi)心扉時(shí)而陰森黑暗，以這種性格確實(shí)很難交到投的來(lái)的朋友。
說(shuō)到這里，赤木向美里提出了豪豬理論，想在一起取暖又怕身上的刺扎到對(duì)方，所以會(huì)保持一段距離，而真嗣就是這樣，他一直都呆在合適的位置，不傷害別人也不被別人傷害。
此時(shí)，真嗣一個(gè)人躺在學(xué)校的頂樓天臺(tái)上，聽(tīng)著隨身聽(tīng)里的歌曲，享受著這短暫的課間活動(dòng)。但綾波麗突然找到了他，說(shuō)有緊急任務(wù)，說(shuō)完便走了。真嗣坐起，摘下耳機(jī)，說(shuō)道“終于來(lái)了啊，使徒”
序-2-完