韓云帶大軍分兩路北上，東路沿著清漳水北上，韓云帶西路沿濁漳水北上。
兩天后，大軍到達(dá)襄桓，城內(nèi)游俠、民兵已經(jīng)控制局勢(shì)。韓云分出五百精銳、五百輔兵，鎮(zhèn)守襄桓；大軍沒有停留，又兵分兩路，一路西行；一路繼續(xù)沿著濁漳水北行。西向大軍很順利地占領(lǐng)了銅鞮、谷遠(yuǎn)。
涅縣提前收到風(fēng)聲，加強(qiáng)了警戒和防守；韓云強(qiáng)攻未果，等到后勤兵帶上來攻城器械，才攻破涅縣城池，城內(nèi)游俠、民兵死傷無數(shù)。
東路順利占領(lǐng)鐐陽、閼與、沾縣，攻打石研關(guān)時(shí)碰到麻煩。大軍到達(dá)石研關(guān)時(shí)，關(guān)口已經(jīng)全面警戒，未能偷襲成功；石研關(guān)狹窄，大軍不能展開，強(qiáng)攻了一天也沒能攻破城墻。當(dāng)天晚上，兩百游俠偷偷爬上山；凌晨時(shí)刻，大軍開始攻城，對(duì)戰(zhàn)雙方在城墻上廝殺時(shí)，兩百游俠從天而降，一舉拿下石研關(guān)。
從走出前進(jìn)基地，大同軍花了半個(gè)月時(shí)間完成第一、第二階段目標(biāo)，進(jìn)入第三階段。
大同軍關(guān)注的十幾家莊園遍布上黨，基本分布在濁漳水、清漳水、沁水、丹水流域。在大軍進(jìn)攻城鎮(zhèn)過程中，大同軍已經(jīng)派后勤兵、本地民兵前去各莊園附近監(jiān)視，阻滯這些莊園的活動(dòng)。現(xiàn)在拿下城鎮(zhèn)、關(guān)口后，大同軍轉(zhuǎn)向莊園。
這些大家族基本都有弟子在大同書院學(xué)習(xí)，甚至有不少在大同內(nèi)社。大同軍采取先禮后兵的方略，詳細(xì)說明大同軍的政策，要求無條件投降。顯然這些莊園不會(huì)那么簡(jiǎn)單就投降，都在觀望其它世族的選擇。
大同軍選了三個(gè)莊園進(jìn)攻。這三個(gè)莊園名聲比較差，防御能力比較強(qiáng)。這次已經(jīng)無法采用偷襲戰(zhàn)術(shù)，里面雖然有醫(yī)師發(fā)展的成員，但無濟(jì)于事，只有強(qiáng)攻一條路。
平原上的兩家比較好解決。大同軍拿出了攻城器具，首先是投石車，幾臺(tái)投石車，不緊不慢地對(duì)著小城墻、城門狂砸，中間還夾雜著火箭。等城上的防護(hù)設(shè)施都爛的差不多了，大同軍士卒推著一輛臨車來到城門前，居高臨下射擊城上的家兵。等城墻上一片混亂時(shí)，幾個(gè)士卒推著沖車來到城門前，以沖車撞擊城門；更多的士卒抬著云梯進(jìn)攻，當(dāng)大批士卒爬上城墻、沖車撞開城門時(shí)，這家莊園選擇投降。
難度最大的是一家山谷里的莊園。這山谷有點(diǎn)類似張家村所在小山谷，一條小溪從山谷里流出形成一條小瀑布；山谷口被一座陡峭的山崖遮掩，另一邊是懸崖峭壁和瀑布。想要進(jìn)山谷，先要爬山，向上走過兩個(gè)彎，一條十幾丈長(zhǎng)的大斜坡正對(duì)著山谷大門，斜坡盡頭有一個(gè)能站十幾個(gè)人的小平臺(tái)。山谷城墻有五丈寬，卡在兩道山崖中間。
山谷里面大概有三千多人，估計(jì)能打仗的有一千多人。朱超試著讓士卒攻擊，上不了斜坡就被箭矢或滾石、滾木壓制。晚上潛行，到不了小平臺(tái)就會(huì)被發(fā)現(xiàn)。
沒辦法，還得用特種游俠。朱超從劉渏親兵、衛(wèi)隊(duì)中挑選了兩百人與兩百游俠曲游俠合在一處，共四百人。朱超準(zhǔn)備爬上山頂，從山頂攻擊。這次爬山工具比較齊備，朱超選擇了一處莊園里的人也爬不上去的陡峭山壁，花了半天時(shí)間，四百人全爬上去，攻擊位置選在大門正上方。一切準(zhǔn)備就緒，四百人吃喝休息。
等到還有半個(gè)時(shí)辰月亮就要出來時(shí)，朱超和十幾個(gè)游俠從山上放下繩索，從懸崖滑落到城門上空。離城還有兩三丈高時(shí)，被守衛(wèi)發(fā)現(xiàn)，十幾人直接掏出刀劍跳到城墻上與守衛(wèi)激戰(zhàn)；其它游俠陸續(xù)從山上滑下來，才逐漸把家兵擠下城墻，這時(shí)候大勢(shì)已去，莊園只有選擇投降。
此戰(zhàn)大同軍死了十幾個(gè)人，莊園死了上百人，無論如何莊園主是肯定要為這些死去的人償命；但為了救全家，家主也是豁出去了。
占領(lǐng)三家莊園后，大同社組織書院、郡學(xué)、縣學(xué)學(xué)子回家勸降。政策都一樣，無條件投降，莊園收歸大同軍所有，只要沒有惡行，經(jīng)過培訓(xùn)，表現(xiàn)好的啟用，職位就是教書師傅、官吏。這些家族得知三家的情況，全部選擇投降。
大莊園解決了，小莊園、家族村自然不在話下。醫(yī)師、游俠齊發(fā)力，大多家族都選擇了投降；也有家族拖家?guī)Э诙萑肷钌蕉惚軕?zhàn)亂。
歷時(shí)一個(gè)月，大同軍占領(lǐng)上黨。上黨這個(gè)地方太貧瘠，總?cè)藬?shù)不到十五萬，不如其它地方一個(gè)大縣，劉渏是撿了一個(gè)大便宜。幽州、涼州、冀州、兗州、青州、豫州大亂，也為大同軍提供了側(cè)面的幫助，這就是天時(shí)吧。六月底，上黨恢復(fù)秩序。
接下來就是如何整合的問題，有醫(yī)師的傳道基礎(chǔ)，所以底層人問題不大，有問題的是大家族和官吏。經(jīng)過商量，大同軍核查每一個(gè)官吏、大家族嫡系成員，是否有劣跡、是否有人命；如果有人命肯定要處死。后來甄選出幾十個(gè)劣跡斑斑的殺頭警示，其余約五千人，青壯送到太行山基地去培訓(xùn)改造，年紀(jì)大、身體不好的到大同書院培訓(xùn)。
現(xiàn)在，上黨最大的問題還是吃飯?；貋砹怂娜f人，差不多相當(dāng)于上黨人口的三成，以現(xiàn)在的上黨肯定養(yǎng)不起。多次協(xié)商后，軍師團(tuán)想出一個(gè)辦法，反正大同軍帶出來的四萬人一定要留在上黨，那么從上黨選出兩萬人送進(jìn)太行山基地就食，基本可以解決吃飯問題。這些人包括前面提到的五千人，五千左右的郡兵、縣兵、義兵；還有上黨游俠、學(xué)子、非農(nóng)業(yè)民兵等湊出了五千人。只選出一萬五千人，也只好如此了，否則會(huì)影響屯耕。
以前大同軍實(shí)行軍管，現(xiàn)在顯然軍管是行不通，只能半軍管。這是又要調(diào)整機(jī)構(gòu)，劉渏開始頭痛，只能自任上黨太守、大同軍中郎將。老師馮鈺任上黨郡郡丞，主管民團(tuán)。劉渏不得不沿用大漢的體系，原來帶出來的兩萬后勤兵被分配下去任縣令、鄉(xiāng)長(zhǎng)、里長(zhǎng)、屯長(zhǎng)、什長(zhǎng)、伍長(zhǎng)。下面的不是按人頭，而是按戶。自然，大家族全部拆分成小戶人家。
一萬正規(guī)軍顯然不夠防守這么大的地盤，所以，軍團(tuán)增加到兩萬人，民兵暫時(shí)還是三萬。其實(shí)，上黨的幾大關(guān)口能夠讓大軍通行，所以才顯得重要。上黨不知道還有多少山路能夠通到外界，只是不適合大軍團(tuán)行走而已。所以，上黨四周，每一個(gè)城都很重要。比如涅縣，就卡在通往晉陽的一條山路口，只是那條路實(shí)在難走。