大戰(zhàn)還是落幕，徐遠舟重傷而歸，御獸宗也暫時打退了敵人們。但回宗不久大長老就駕鶴西去。
徐遠舟回來后被宗內(nèi)其他勢力軟禁在了聯(lián)盟監(jiān)獄！呂靈兒為了救他也慘敗，跟徐遠舟被關(guān)押在一起，因為徐遠舟傷勢嚴重，呂靈兒憂心忡忡，使了很多辦法想幫徐遠舟療傷，但因為監(jiān)獄內(nèi)條件有限，只能眼睜睜看著徐遠舟傷勢嚴重，雖然新覺醒了一層，但是并沒有緩解傷勢，覺醒增加的靈力因為結(jié)丹瓶頸也在體內(nèi)蓄積。
外戰(zhàn)剛歇，內(nèi)戰(zhàn)又起，三大家族聯(lián)盟討伐徐家，說徐家徐遠舟乃禍亂之源，要求徐家親自鎮(zhèn)殺徐遠舟提取氣運，并獻出家族財權(quán)和所有靈寶以此賠償，徐家表面上跟三大家族交涉拖延時間，暗地里派人協(xié)助呂靈兒照顧徐遠舟，呂靈兒確定徐家不會真的應三大家族聯(lián)盟的要求處決徐遠舟才放下心來。
家族大戰(zhàn)一觸而發(fā)，呂靈兒在牢獄里第一次使用先天神通，用自己的血替他療傷，在他體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了一縷不屬于這個時代的“神識”，自己還覺得頗為熟悉。第一療傷后，二人的神魂意外合一，打卡神合融血之地，再覺醒一層，第三層，她沒將這件事告知徐家，而是繼續(xù)用自己的血替徐遠舟療傷，同時傳給徐家徐遠舟身體好轉(zhuǎn)的消息。
在呂靈兒的悉心照料下，徐遠舟身體逐漸好轉(zhuǎn)，呂靈兒卻因為失血過多陷入昏迷，徐遠舟只好找靈藥醫(yī)治呂靈兒。
徐遠舟一覺醒來，面對各大家族一齊討伐，十大法器對準了他，要把他當做魔族來滅掉，意外激發(fā)了他的力量，呂靈兒的血流竄在他身體里，橫沖直撞，最后一刻沖破丹田沖破了筑基，當場一道金光之后，徐遠舟結(jié)丹了！
還結(jié)出了兩顆金丹！
同時，呂靈兒在角落里口吐鮮血，靈力迅速流逝。她能明顯感覺到自己的靈力逆向流給了徐遠舟，以為這是她神通必遭的反噬。隱瞞了傷勢！
徐遠舟這才知道呂靈兒為了給他療傷，隱瞞了自己的傷勢，逆天而為，徐遠舟照顧重傷的呂靈兒，悔不當初，呂靈兒很快醒來，得知徐遠舟沒事，二人激動的擁抱在一起。
徐遠舟結(jié)出的金丹，一顆是屬于自身的，一顆是屬于體內(nèi)真神神識的！
在各大家族面前結(jié)丹時，許多元神大能都被波及受傷，嚴重的甚至直接被吊打的退了境界，平常的結(jié)丹不可能造成這樣的動靜，大家對于這種未知的情況充滿惡意！
原本是徐家團寵的徐遠舟，一天之內(nèi)成了仙朝大陸上所有家族的敵人！
因為他結(jié)了兩顆金丹！
眾人都認為其中一顆是他身為災星的妖丹，這是覺醒的第三層，第三層真神神識覺醒后結(jié)丹后開始大量吸取世界靈機，大陸上千百個靈氣森林一夜之間全部枯萎，他游歷過的骸骨龍城像被遺留下的瘴氣一般，靈食覆毒，一夜荒蕪。
在大家的恐慌下，準備制裁徐遠舟，徐家人搶先送出徐遠舟，把他藏在東郊山野的荒蕪洞穴里。那里四周荒蕪，靠近就消耗修為，沒人會來，呂靈兒留下照顧徐遠舟，其他人返回，這期間還有其他家族的人過來找茬，但每次呂靈兒都拼死護住徐遠舟，其他人嘲諷徐遠舟是躲在女人后面的軟蛋，徐遠舟承諾半年后正式接受其他家族的挑戰(zhàn)，呂靈兒認為半年的時間太短，非常擔憂，但還是細心照料徐遠舟。
可此時，徐遠舟的覺醒已經(jīng)遠遠無法停止，和女主發(fā)生各種感情關(guān)鍵事件，比如親吻，相擁而睡，負距離接觸，懷孕。
在極短的時間內(nèi)，一層又一層的覺醒，修為大增，天雷浩劫突降荒蕪洞穴，仙朝大陸不周山倒塌，一夜之間徐遠舟的兩顆金丹孵化元嬰，震驚整個大陸?；氖彾囱ㄉ瞎啪掾鍪溃沙箨懭珕T橋接結(jié)界，關(guān)鍵時刻是徐遠舟出現(xiàn)幾番殊死搏斗斬殺上古巨蟒，從其腹中拔出了上古真神的“斬元劍”！救了大陸上的人。
還幫助呂靈兒恢復了靈力。
劍氣磅礴，承載的靈氣十分充盈，系統(tǒng)下達覺醒獎勵——《歸元大法》
他只修了一夜的歸元法合并覺醒附加的修為大漲，天雷加身卻毫發(fā)無傷，一個元嬰在九九八十一道天雷里經(jīng)歷了分神合體后，直沖化神境界。
這時，神武娘將心因為之前救治徐遠舟修為大損，壽元折盡，千年壽元只余下短短數(shù)十年！御獸宗和徐家就徐遠舟一事達成協(xié)議，徐家表面放棄徐遠舟，私下里派陳青青等親朋，前往荒蕪洞穴尋找徐遠舟，因為御獸宗將發(fā)動了獸類召喚術(shù)法，他們控制的獸類不只有玄武神龜，是三界內(nèi)所有獸靈，去攻擊消滅徐遠舟。
森林枯萎、神殿坍塌、靈石靈爆！百獸群起而攻之，百族和百獸的戰(zhàn)爭一觸即發(fā)，唯有徐遠舟的死能平息這一場大戰(zhàn)。
勢力一分為三，散修們四處尋覓他要把他交給御獸宗，徐家的人和神武娘找徐遠舟要保護他，御獸宗發(fā)動獸類全開嗅覺搜索他，呂靈兒想方設法把徐遠舟藏匿起來，不想御獸宗的人發(fā)現(xiàn)，同時把散修們攔截在外面，也找機會跟徐家和神武娘取得聯(lián)系，在呂靈兒的庇護下，徐遠舟的修為漲速更快，幾乎不受控制，那些散修們也不是徐遠舟的對手，徐遠舟用散修們聯(lián)手，為呂靈兒出氣。
御獸宗有暗戀呂靈兒的弟子，更是嫉恨呂靈兒一直守在徐遠舟身邊，把徐遠舟當死敵看待，暗地里脫離御獸宗，去襲擊徐遠舟，但都徐遠舟斬殺，徐遠舟拼死護住呂靈兒，令呂靈兒更加依戀徐遠舟。
荒蕪洞穴內(nèi)，徐遠舟體內(nèi)兩股神識沖擊不止，甚至會波及到呂靈兒，徐遠舟擔心會傷到呂靈兒，選擇把呂靈兒支開，默默忍受，獨自化解！
合體、分離、循環(huán)往復！直到徐遠舟的身體發(fā)生巨大變化，難以自控，呂靈兒擔心不已，于是決定趁著把徐遠舟轉(zhuǎn)移到更隱蔽的地方時，獨自去尋找徐家人和神武娘，呂靈兒出現(xiàn)在鎮(zhèn)上，遇到不少散修和御獸宗的探子，但都被機智的呂靈兒避開，同時呂靈兒也知道徐遠舟的處境更加艱難，她必須盡快跟徐家人和神武娘取得聯(lián)絡。
直到呂靈兒外出探查時接到聯(lián)絡信息接到徐家人徐遠航陳青青等，帶著呂家人，當初一起冒險的小伙伴們，徐家給呂靈兒帶來一本上古典籍，還說有重要的事，必須同時當著呂靈兒和徐遠舟的面說。
呂靈兒到這徐遠航等人找到徐遠舟，徐遠航向眾人包括徐遠舟開誠布公的說出了他的身份！
他原本是上古時代隕落的真神，真神重新降世歸位，也是滅世之劫。百獸之戰(zhàn)，百族紛爭一切都在曾經(jīng)的藏寶閣里早有一顆應生石預言了，只是那一顆應生石一直被呂氏一族守護著，現(xiàn)在呂家選擇將這個秘密告訴徐家，呂靈兒出生就是預言驗證，從現(xiàn)在起，呂靈兒必須時刻跟隨在徐遠舟身邊，時刻準備為徐遠舟真神歸位效力。
于是，呂靈兒也明白了為什么自己家族必須和徐家締結(jié)婚約，她的出生原本就是為了助力真神歸位，而之前父母就算是徐遠舟受傷，都支持她跟徐遠舟在一起，其實也是早就知道她跟徐遠舟的真實身份，她深愛徐遠舟，自然愿意為徐遠舟做出任何事，甚至不惜獻出自己的生命。
徐遠航留下《上古典籍》給徐遠舟和呂靈兒，還說要呂靈兒助攻徐遠舟，徐遠舟和呂靈兒一開始不明白什么意思，但翻看典籍后，才發(fā)現(xiàn)助攻徐遠舟的辦法，徐遠舟不同意，最后在某個危機時機，呂靈兒的堅持下單方面結(jié)下歃血盟約，用自己的先天神通幫助徐遠舟重新神魂合體，達到了巔峰。最后一刻她元神盡數(shù)消散了……
徐遠舟達到巔峰時，身體破碎，真身元嬰破體而出！橫掃戰(zhàn)場，成為時代重回上古時期的第一位新誕生的真神，雖然身邊沒有了呂靈兒，但他一直感覺到呂靈兒活在他身體里，后面身邊陸續(xù)又出現(xiàn)了不少女人，都對徐遠舟懷有不同的心思，徐遠舟因為心中一直有呂靈兒，對那些女人再無動情！
百族之戰(zhàn)、百獸之戰(zhàn)結(jié)束后，萬物復蘇，法則被重新規(guī)定，靈氣充盈！