故事劇情連接第五部結(jié)尾，會(huì)加入大量傳說(shuō)的寶可夢(mèng)和大量mega進(jìn)化。翻譯方面主要采用官譯（即將神奇寶貝、寵物小精靈、口袋妖怪通通譯為精靈寶可夢(mèng)，精靈和技能名稱采用官譯為主，有時(shí)如果記不起來(lái)有官譯的可能會(huì)采用民間翻譯）。

　　各地反派會(huì)復(fù)活，同時(shí)操控各種傳說(shuō)的寶可夢(mèng)。劇場(chǎng)版采用“部分平行”（即部分劇場(chǎng)版與小說(shuō)為平行關(guān)系，少數(shù)劇場(chǎng)版與小說(shuō)同線）。

　　結(jié)局方面采用“多分支結(jié)局”（即智霞結(jié)局、智遙結(jié)局、智光結(jié)局、智艾結(jié)局、智瑟結(jié)局、后宮結(jié)局，后宮結(jié)局除女主外還有如莉拉、科爾尼等）。